Había una vez en los tiempos precolombinos en el territorio actual de Zapatoca fue habitado por el pueblo indígena Guane. Su actividad mas destacada era la pesca y la agricultura.Ellos sembraban: maíz, algodón y tabaco, gracias a los cañones de los ríos Suárez, Sogamoso y Chicamocha permitieron el trueque que consiste en intercambiar un objeto por otro. Un tipo de trueque podría ser intercambiar sal por maíz, o pescado por conchas y mas. Ellos lo intercambiaban con sus vecinos de Barichara y Yariguies ubicados al occidente de su territorio. Su clima eran variado, en unas veces llovía y en otras hacia sol, pero su clima mas seguido era la neblina.
Lo que ellos no sabían, era que los españoles atacarían su territorio en pocos días, hasta que llegó el día, los españoles tenían armas y estaban montados en fuertes caballos en comparación de los indígenas que solo tenían lanzas, aunque los españoles no venían solo por su territorio sino que también querían que fueran sus esclavos y los Guanes no tuvieron otra opción que aceptar hasta que casi los acaban.
Los días pasaban y los Guanes sobrevivientes poco a poco se acababan hasta el punto de quedar totalmente extintos.
